Bu çalışmada hedef proteinin yapısı hem homoloji modellerle hem de AI tabanlı yöntemlerle tahmin edildi ve karşılaştırıldı. Genel olarak yapılar birbirlerine benzer olmasına rağmen bazı loop ve düşük pLDDT içeren alanlarda farklar gözlemlendi. CATH ve SCOPe analizleri sayesinde proteinin yapısı daha iyi anlaşıldı ve bu domainlerin fonksiyonla ilişkili olabileceği görüldü. Motion analizinde proteinin bazı bölgelerinin nasıl hareket ettiği ve fonksiyonuyla alakalı olabileceği düşünüldü. Docking analizinde, özellikle ARG291 mutasyonu sonrası etkileşimlerin kaybolması ve GLY312 mutasyonu sonrası sterik clash bu bölgelerin bağlanmada önemli rol aldığını düşündürdü. Genel olarak bu çalışma bana yapı, hareket ve etkileşim arasında önemli bir bağ olduğunu gösterdi.

In this study, the structure of the target protein was predicted and compared using both homology models and AI-based methods. Although the structures were generally similar to each other, differences were observed in some loops and areas containing low pLDDT. Thanks to CATH and SCOPe analyses, the structure of the protein was better understood and it was seen that these domains may be related to function. In motion analysis, it was thought that some regions of the protein might be related to how it moves and its function. In the docking analysis, the loss of interactions especially after the ARG291 mutation and the steric clash after the GLY312 mutation suggested that these regions play an important role in binding. Overall, this work has shown me that there is an important connection between structure, movement, and interaction.