Ligand stabilitesini bozabilecek iki tekli amino asit mutasyonu PyMOL “Mutagenesis” aracıyla modellenmiştir. İlk olarak, pozitif yüklü Arjinin (ARG-291), negatif yüklü Glutamat’a (GLU-291) dönüştürülmüştür. Bu değişim, hidrojen bağlarını ortadan kaldırmanın yanı sıra güçlü bir elektrostatik itim oluşturarak bağlanmayı termodinamik olarak elverişsiz hale getirmiştir (Figure \ref{fig:so4}B) İkinci olarak, büyük bir yapı olan Tirozin (TYR-319) küçük olan Alanin’e (ALA-319) çevrilmiştir. Bu mutasyon, hem hidrojen bağı kaybına hem de cepte sterik bir boşluk oluşmasına yol açmıştır (Figure \ref{fig:so4}C). Oluşan paketlenme eksikliği, ligandın kararlılığını azaltır. Böylelikle ligandın pose konumu değişebilir ya da ligand proteinden ayrılabilir.

Two single amino acid mutations that could disrupt ligand stability were modeled with the PyMOL “Mutagenesis” tool. First, positively charged Arginine (ARG-291) was converted to negatively charged Glutamate (GLU-291). In addition to eliminating hydrogen bonds, this change created a strong electrostatic repulsion, making the bonding thermodynamically unfavorable (Figure \ref{fig:so4}B). Secondly, the large structure, Tyrosine (TYR-319), was converted into the small, Alanine (ALA-319). This mutation led to both loss of hydrogen bonding and the formation of a steric gap in the pocket (Figure \ref{fig:so4}C). The resulting lack of packaging reduces the stability of the ligand. Thus, the pose position of the ligand may change or the ligand may be separated from the protein.